El CTA esta cuenta con numerosas alianzas, tanto nacionales como internacionales:
Red Regional de Cambio Climático y Toma de Decisiones
ReBiBiR es la Red Iberoamericana de Tecnologías de Biomasa y Bioenergía Rural.
La Red Iberoamericana de Eficiencia Térmica Industrial (RIETI), se enmarca en el Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el Desarrollo, CYTED
La Red Iberoamericana en Gestión y Aprovechamiento de Residuos (REDISA)